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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
(新春走基层)中老铁路上演“列车春晚” 中老泰三国民众共庆“中国年”******
中新网昆明1月19日电(缪超 黄再云 张伟明)中国京剧、汉服舞、茶艺表演、写春联送福字、老挝乐曲、泰国舞蹈……19日，在时速160公里的中老铁路C272次动车上，举行了一场以“中老一家亲，祥和中国年”为主题的中老铁路“列车春晚”。
北起中国昆明，南连老挝万象，全长1035公里的中老铁路作为“一带一路”的标志性工程，开通运营一年多来，其影响已外溢到泰国、马来西亚、新加坡等诸多国家和地区，区域互联互通、共同发展的带动效应明显，沿线商贸民生受惠颇多。
图为演员与小乘客互动。 李嘉娴 摄当天的“列车春晚”于10时开始，随着《让我听懂你的语言》音乐响起，身着民族服饰的中国傣族姑娘依波逢翩翩起舞，车厢内顿时热闹起来。依波逢来自云南西双版纳傣族自治州，曾到老挝留学。回国后，她成为中老铁路列车员，“我一直在提升自己，服务好旅客，当好中老友谊的使者。”
依波逢的舞蹈刚结束，云南省京剧院的青年演员登场唱起《贵妃醉酒》选段，“海岛冰轮初转腾，见玉兔，玉兔又早东升。”含蓄婉转的唱腔，雍容华贵的扮相，赢得旅客阵阵掌声。
图为演员在列车上表演《贵妃醉酒》选段。 李嘉娴 摄“春节来临，我们将京剧这一中国国粹搬上中老铁路动车，是想让中老泰三国民众感知中华优秀传统文化的独特魅力。”云南省京剧院青年演员张雯琦说。
京剧唱罢，老挝乐曲唱响。乘坐C272次动车从昆明前往西双版纳研学的老挝籍铁道教师李灵美、陈尚德伴着悠扬的老挝乐曲，带动旅客们一同跳起老挝舞蹈。陈尚德告诉记者，“我们正在昆明铁道职业技术学院学习铁路知识，学成回国后将成为老挝铁路职业技术学院的老师，我们将为老挝培养更多铁路人才，维护好、运营好老中铁路，开发好、建设好老中铁路。”
“能在中老铁路列车上体验到中国的年味，很温馨！”泰国旅行者陈慕筠兴奋地加入到联欢互动中，现场教授旅客们泰国舞蹈，“我非常期待泰中铁路早日建成，与中老铁路连通，这样我们的国家就能更好地融入区域发展，泰中两国就有更多经济文化交流。”
图为旅客和列车员举对联合影留念。 李嘉娴 摄国之交在于民相亲，民相亲在于心相通。“中老一家亲，祥和中国年”中老铁路“列车春晚”每一个节目都为中老泰三国旅客带来特别的欢乐，车厢里不时传出一阵阵笑声。
据悉，今年春运以来，中老铁路中国段客流激增，旅客主要以探亲流、旅游流和学生流为主，中国铁路昆明局根据客流需求，精准投放运力，日均开行28对动车组列车，每天发送3.7万人次，高峰期达到35对，每天发送旅客4.4万人次，有效满足了旅客出行需求。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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